Gemilerde konteyner içerisinde farklı ürün gruplarına ait yükler rahatlıkla taşınabiliyor. Bu sayede hem yerden tasarruf sağlanırken maliyet olarak da yararı olmaktadır.

Konteyner taşımacılık ile parsiyel taşımacılık bir arada olabilmektedir. Komple yükleme yapılamadığı durumlarda parsiyel taşımacılık tercih edilip, birçok müşterinin yükü tek bir konteyner içine yerleştirilebilmektedir. Bu sayede hem maliyet düşmektedir hem de zaman kazanılmaktadır.

Gemilerle deniz aşırı ülkelere yapılacak taşımacılık için, denizyoluyla yapılan konteyner nakliyesi lojistik sektöründe en ucuz taşımacılık yöntemi olarak öne çıkıyor.

Yine konteyner taşımacılığının bir diğer avantajı ise denizyolu ile nakliyenin tercih edildiği ortaya çıkıyor. Bu sayede gemilerin limanda daha az beklemesi maliyeti düşüren bir etkendir. Çünkü konteynerların gemiler gelmeden önce hazır olması zaman tasarrufu sağlıyor.